Antoine Guisan développe des modèles prédictifs de distribution d’espèces (faune, flore, micro-organismes…), notamment dans les Alpes vaudoises. Il développe des modèles pour la gestion des espèces rares, l’évaluation de l’impact des changements climatiques sur la biodiversité et l’anticipation des invasions biologiques. Il fait partie des auteur·e·s suisses du IPBES, où il traite des interactions entre la nature et la société et des dynamiques futures de la biodiversité. Il est aussi responsable du groupe d’écologie spatiale Ecospat de l’UNIL.

Antoine Guisan est professeur ordinaire à la Faculté des géosciences et de l’environnement ainsi qu’à celle de biologie et de médecine de l’UNIL depuis 2017. Il a effectué son doctorat à l’Université de Genève et un post-doctorat à l’Université de Stanford. En 2022, il a été récompensé par la Société internationale de biogéographie pour ses avancées théoriques et méthodologiques sur la compréhension et à la prédiction des distributions d’espèces et des communautés.